ジャコウジカ科(Moschidae)は偶蹄目反芻類の一科。ジャコウジカが含まれる。長い犬歯が特徴。角はない。大きさはあまり大きくない。(ジャコウジカ属において体重は17kg、他の分類群ではより小さい。)顔に腺はない。この科の化石記録は漸新世、2,800万年前まで遡る。化石は中新世のユーラシアと北アメリカに多く産出するが、その後多様性は減り、更新世初期には現生属であるジャコウジカ属(Moschus)のみとなった。