クロイボタケ綱(Dothideomycetes)は子嚢菌門チャワンタケ亜門に属し、23目110科におおよそ1300属19000種をふくむ綱。かつて小房子嚢菌綱(Loculoascomycetes)と呼ばれていた分類群に大雑把に対応しているが、小房子嚢菌のうち系統的に離れた菌についてはユーロチウム菌綱へと移されている。植物病原体として重要な種が含まれているが、大半は内生菌か、倒木、落葉、糞などにつく腐生菌である。少数だがを作るものもある。