Microsoft Windows Neptune（マイクロソフト ウインドウズ ネプチューン）は、マイクロソフトのベータ版オペレーティングシステム（OS）のコードネームである。当時はまだビジネス向けと位置づけられていたWindows 2000をベースにWindows NT系のカーネルで、一般家庭向けOSを作る計画であったが頓挫し、代わりに9x系列カーネルでWindows Meがリリースされた。 バージョン5.1として開発されていたが、2000年1月頃に、Microsoft Neptune開発チームとWindows Odyssey（後述）開発チームが結合し、コードネームWhistler（Windows XP）へと方針転換された。
