Microsoft Windows Neptune(マイクロソフト ウインドウズ ネプチューン)は、マイクロソフトのベータ版オペレーティングシステム(OS)のコードネームである。当時はまだビジネス向けと位置づけられていたWindows 2000をベースにWindows NT系のカーネルで、一般家庭向けOSを作る計画であったが頓挫し、代わりに9x系列カーネルでWindows Meがリリースされた。 バージョン5.1として開発されていたが、2000年1月頃に、Microsoft Neptune開発チームとWindows Odyssey(後述)開発チームが結合し、コードネームWhistler(Windows XP)へと方針転換された。