2006年の北海道日本ハムファイターズ(2006ねんのほっかいどうにっぽんハムファイターズ)では、2006年の北海道日本ハムファイターズにおける動向をまとめる。 この年の日本ハムファイターズは、トレイ・ヒルマン監督の4年目のシーズンであり、1981年以来、25年ぶり3度目のリーグ優勝と1962年以来、44年ぶり2度目の日本一に輝いたシーズンである。