2006 ワールド・ベースボール・クラシック・プエルトリコ代表は、2006年3月に開催されたワールド・ベースボール・クラシック第1回大会に出場したプエルトリコ代表である。監督は(MLBセントルイス・カージナルス三塁コーチ)が務めた。