1999 UEFAスーパーカップ(英語: 1999 UEFA Super Cup)は、1972年に創設されてから24回目(1972年大会は非公式扱い)のUEFAスーパーカップである。 1998-99シーズンでUEFAカップウィナーズカップが終了したため、UEFAチャンピオンズリーグ優勝チームとUEFAカップウィナーズカップ優勝チームが対戦する方式では最後の大会となる。 UEFAチャンピオンズリーグ 1998-99優勝のマンチェスター・ユナイテッドとUEFAカップウィナーズカップ 1998-99優勝のラツィオが対戦した。ラツィオが1-0で勝利し、初優勝を飾った。