長い末端反復 (英: Long terminal repeat, LTR) とは、同じ配列が数百から数千回繰り返すDNA配列で、レトロトランスポゾン、もしくはレトロウイルスRNAが逆転写されて生じるプロウイルスDNAの、両端にみられる。ウイルスが自身の遺伝物質を宿主ゲノムに挿入するために用いる。