代替燃料（だいたいねんりょう、英:alternative fuel）とは、化学反応・原子核反応を外部から起こすことなどによってエネルギーを発生させる燃料で、天然の石油を代替する燃料のことである。石油需要の急増と、枯渇が近いと目される中、石油価格の上昇が続いているため、盛んに研究されている。 なお、代替エネルギーという言葉は、輸送機関エネルギー源において石油を代替する物を指し（電気・原子力・化石燃料を含み）、産業・発電エネルギー減において化石燃料を代替するものを指す（原子力を含む）。他方、新エネルギーという場合は一般に原子力を含まない。
