長崎県離島医療圏組合（ながさきけん りとういりょうけんくみあい）は、長崎県下の離島の医療体制を確保するために、長崎県と、壱岐、五島、対馬の3つの大型離島に位置する市町村が設置した特別地方公共団体（一部事務組合）である。2009年4月1日に長崎県病院事業と統合し、長崎県病院企業団となり、本組合は消滅した。 離島地域における中核的役割を果たす病院の設置・運営や、離島医療の充実のための医師の確保や研修を行っていた。
