本田 由紀(ほんだ ゆき、1964年(昭和39年)12月24日 - )は、日本の教育学者。博士(教育学)。東京大学大学院教育学研究科教授。専門は教育社会学、教育システムと他の社会システムとの関係およびその変化に関する実証的・理論的研究。旧姓は沖津。