本因坊 秀元（ほんいんぼう しゅうげん、1854年（安政元年） - 1917年（大正6年）9月5日）は、囲碁の棋士、16世・20世本因坊秀元、六段。本因坊秀和の三男で、本名は土屋百三郎。法名は日存。19世本因坊秀栄没後の後継者争いにおいて、一旦自らが20世襲位して田村保寿に地位を譲った。 四男の土屋一平は囲碁棋士となり、将来を嘱望されたが、19歳で死去した。孫の土屋半七（長男・万吉の子）も棋士として二段までなったが、1952年に32歳で夭折。
