新函館農業協同組合(しんはこだてのうぎょうきょうどうくみあい、英称:JA Shinhakodate )は北海道北斗市に本所を置く農業協同組合である。略称はJA新はこだて。当農協の担当地区は 北海道南部の、渡島総合振興局・檜山振興局の一円の内、函館市の北部・鹿部町・福島町・松前町・今金町を除く地域である。