在ニューヨーク日本国総領事館(英語: Consulate-General of Japan in New York)は、アメリカ合衆国最大の都市ニューヨークに設置されている日本の総領事館である。 2018年10月1日時点で、在外公館別在留邦人数は、在ロサンゼルス日本国総領事館(9万7209人)に次いで第2位(8万3237人)となっている。 管轄地域は、ニューヨーク州、ニュージャージー州、ペンシルベニア州、デラウエア州、ウエストバージニア州、コネチカット州のうちフェアフィールド郡、プエルトリコ、アメリカ領ヴァージン諸島。