別院村(べついんむら)は、和歌山県那賀郡にあった村。現在の海南市の北東端、貴志川が大きく向きを変え、東北に下る左岸に位置する。地名の由来は、紀伊続風土記によると、石清水八幡宮の野上荘に別宮として野上八幡宮が創建され、その別院として、金剛遍寺(こんごうへんじ)、金剛宣寺(こんごうせんじ)が建立されたことによる。