代替医療（だいたいいりょう、英: alternative medicine）は、「現段階では通常医療と見なされていない、さまざまな医学・健康管理システム、施術、生成物質など」を意味する。自己判断・自己責任で行うもので費用は全額自己負担であり、米国の国立補完代替医療センターでも民間療法と同義としている。 抗がん剤治療と緩和療法が専門の医師は、丸山ワクチンをはじめとする代替補完医療選択の結果、ステージⅢまでの乳がん、前立腺がん、肺がん、大腸がんの患者の生存曲線は、84ヶ月後で「代替補完医療なし＝約83％」「代替補完医療を選択＝約70％」と死亡リスクは約2倍（ステージⅡでは2.7倍、Ⅲでは8倍、乳がんでは8倍、肺がんで53倍、大腸がんで5.9倍）の大差がついているとしている。この理由は標準治療の拒否や、遅れが原因であると推測されるとしている。
