京都府の二級水系一覧（きょうとふのにきゅうすいけいいちらん）では、京都府を流れる水系のうち、京都府が管理する二級水系を記述する。2010年4月現在、36水系、89河川ある。 リストの順序は、河口の位置を基準に、福井県境から西に向かって並んでいる。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。
