マディソン郡 (マディソンぐん、英: Madison County) はアメリカ合衆国アイダホ州内に位置する郡である。2000年現在の国勢調査で、人口は27,467人である。ここの郡庁所在地はである。マディソン郡はアイダホ州レックスバーグ小都市統計地域の一部である。