ボナー郡（英: Bonner County）は、アメリカ合衆国アイダホ州の北部に位置する郡である。2010年国勢調査での人口は40,877人である。郡庁所在地はサンドポイント（人口7,365人）であり、同郡では人口最大の都市である。1907年に設立され、郡名はこの地で渡し船を運航したエドウィン・Ｌボナーに因んで付けられた。
