ヘルムホルツ方程式(ヘルムホルツほうていしき、英: Helmholtz equation)は、ヘルマン・フォン・ヘルムホルツの名にちなむ方程式で、 という楕円型の偏微分方程式である。ここではラプラシアン、k は定数、A = A (x, y, z) は3次元ユークリッド空間 R3 で定義された未知関数である。k = 0 はラプラス方程式である。