フットボールリーグ2000-2001シーズンは、イングランドフットボールリーグの103回目のシーズンである。 ディヴィジョン1はフラム、ディヴィジョン2はミルウォール、ディヴィジョン3はブライトン・アンド・ホーヴ・アルビオンが優勝した。 フットボールカンファレンス1999-2000のチャンピオンのキダーミンスター・ハリアーズが、ディヴィジョン3に初昇格してフットボールリーグに参戦した。 同シーズンのFAプレミアリーグについては「FAプレミアリーグ2000-01」を参照のこと。