フォーティナイナー系(フォーティナイナーけい、Forty Niner Line)は、馬(主にサラブレッド)の父系(父方の系図)の1つ。フォーティナイナー自身はアメリカ合衆国で種牡馬入りしリーディングサイアーに輝いたが、その前に日本に輸出されていたため、その後は有力種牡馬を輩出することができなかった。アメリカに残されたG1優勝馬の多くも日本に輸出されたため後継種牡馬を残すことが難しかったが、G1未勝利のディストーテッドヒューマーがアメリカリーディングサイアーに輝くなど、競走実績に関わらず父系を広げている。