バイカル自然保護区(バイカルしぜんほごく、英語: Байка́льский запове́дник)はロシア連邦の国立自然保護区。 1969年9月26日創立。バイカル湖南部の東岸、ブリヤート共和国内に位置する。大部分がハマル=ダバン山脈に重なる。面積165,724ha。周囲は幅0.5~4kmの緩衝地帯に囲まれる。 最高地点は標高2316mのソホル山(г. Сохор)の頂上。