ハプログループC1 (Y染色体)(ハプログループC1 (Yせんしょくたい)、英: Haplogroup C1 (Y-DNA))とは分子人類学において人類の父系を示すY染色体ハプログループ(型集団)の分類で、ハプログループC (Y染色体)の子型のうち「C-F3393」の変異によって定義されるグループである。