チャールズ・ジョゼフ・ボナパルト(Charles Joseph Bonaparte, 1851年6月9日 - 1921年6月28日)は、アメリカ合衆国の政治家・弁護士。セオドア・ルーズベルト大統領の下で1905年から1906年まで第37代海軍長官を、1906年から1909年まで第46代司法長官を歴任した。ボナパルト一族であり、フランス皇帝ナポレオン1世を大伯父、ヴェストファーレン王イェローメを祖父に持つ。