ジョンソン郡 (ジョンソンぐん、英: Johnson County) はアメリカ合衆国アイオワ州に位置する郡である。2000年現在、人口は111,006人である。ここの郡庁所在地はアイオワ大学の本拠地アイオワシティである。ジョンソン郡は第9代アメリカ合衆国副大統領リチャード・メンター・ジョンソンの名を取って命名された。