カルバペネム耐性腸内細菌 (Carbapenem-resistant enterobacteriaceae, CRE) は、カルバペネム系抗生物質やβ-ラクタム系抗生物質を分解する酵素のカルバペネマーゼを産生する腸内細菌科の細菌の総称で、大腸菌や肺炎桿菌など多くの菌が該当する。