欧州連合の専門機関(おうしゅうれんごうのせんもんきかん)は、特定の専門領域に関する任務を行うために設立された欧州連合 (EU)の組織であり、欧州連合の7つの機構とは区別される。各専門機関はそれぞれ法人格を有する。