分子電子遷移(ぶんしでんしせんい、英: molecular electronic transition)は、分子中の電子があるエネルギー準位からより高いエネルギー準位へ励起した時に起こる。この遷移に関連するエネルギー変化は、分子の構造に関する情報から与えられ、色といった多くの分子の性質を決定する。電子遷移に関与するエネルギーと放射の周波数との間の関係はによって与えられる。